集美大学航海教育始于著名爱国华侨领袖陈嘉庚先生1920年创办的集美学校水产科（水产、航海）、商科，迄今已有百年历史。在长期办学过程中，学校始终坚持“嘉庚精神立校，诚毅品格树人”的办学理念，为国家和民族培养了7万多名各级各类航海专门人才，是我国培养高级航海人才的重要基地。学校航海类专业面向全国20多个省（市、自治区）招生，招生范围广、规模稳定、生源充足、质量好，毕业生深受航运企业单位的欢迎。

学校的航海教育与船员培训设置有航海学院、轮机工程学院、继续教育学院（船员培训中心）、诚毅学院商船系、诚毅船务公司等四个教育与培训单位和一个航运企业单位。其中诚毅学院商船系依托航海学院和轮机工程学院办学，创新办学机制和人才培养模式，积极探索教学改革和教育制度改革的创新途径，多渠道培养航海急需人才，为地方经济建设和促进社会全面协调发展而不懈努力。

学校航海类水上专业共设置航海技术、轮机工程、船舶电子电气工程三个专业，培养层次包括博士研究生、硕士研究生、全日制本科生等，同时，学校面向社会举办了船长、大副、轮机长和大管轮岗位适任培训，高级船员适任证书再有效培训，履约过渡期适任培训，船上医护、船舶保安、大型船舶操纵等船员合格证培训等15类培训项目。学校还是国内唯一一所获准开展台湾船员无限航区海船船员适任培训的高校，为两岸文化交流和行业人才培养发挥应有作用。

学校航海教育历来重视学生实践能力的培养，不仅投入大量经费用于不断完善航海教育办学条件（包括教学场所、实验仪器设备、航海图书资料、学生宿舍、体育设施的完善），2009年“海上专业实验教学中心”获进教育部评为“国家级实验教学示范中心”；2014年“海上专业虚拟仿真实验教学中心”获教育部评为“国家级虚拟仿真实验教学中心”，2019年5月学校获交通运输部海事局确定为第一批“中国海事局海船船员评估试点考场”之一。学校还与国内主要航运企业签订长期校企共建合作协议，采用“走出去、请进来”的方式，进行毕业生教育质量跟踪，及时了解掌握航海技术最新发展动态，聘请航运企业技术人员担任客座教授和课程讲座教师。特别值得一提的是，学校与中国远洋海运集团有限公司签定协议共建校外实习基地，这种校企合作共建校外实习基地，解决航海教学实习的方式是国内航海院校中破解航海类学生实习难题最成功的模式，多次受到交通运输部和教育部领导的充分肯定。

学校航海教育卓有成效，人才培养质量获得社会多方认可。2021年4月学校接受交通运输部海事局组织的航海教育培训质量评估，获得“优异”的评估结果。在五年的评估结果有效期内，交通运输部海事局认可我校组织的全日制航海类专业本科毕业生无限航区二副（含GMDSS通用操作员）、二管轮、电子电气员对应全部理论科目考试成绩；认可我校组织的全日制航海类本科生基本安全培训、专业技能适任培训考试成绩。

2023年11月，我校船员教育和培训质量管理体系顺利通过部海事局组织的换证审核。通过体系的持续有效运行，学校航海教育质量和人才培养质量都得到了有效提升，毕业生就业率高，用人单位满意度高。2024年3月7日，我校代表国家顺利迎接履行履行STCW公约第五次独立评价工作组进校开展现场评价工作。

学校还是大陆唯一获交通运输部海事局批准具有开展台湾船员适任培训资格的院校，也是亚洲航标培训基地、福建省及集美区台湾青少年研学旅游基地、福建省首批“海外华文教育基地”。2013年至今先后开展了台湾船员过渡期适任培训、台湾船员换发大陆证书补差培训、台湾船员大陆适任证书知识更新培训、海峡两岸国际邮轮人才联合培养班等，累计培训台湾船员600多人次。